实际体验从启动 DDA 质谱仪文件,到使用 MS Amanda 进行肽段搜索,再到从搜索结果中构建谱图库并最终从 DDA 文件的 MS1 谱图中提取色谱图进行定量分析的过程。在本教程中,您将使用 Skyline Peptide Search 应用程序向导来搜索 3 个 DDA 数据文件,它们是从添加了稳定同位素标记的蛋白质 Sigma Alrich UPS1 标准混合物的人类全细胞裂解物中采集的。您将设置 Skyline来从数据文件的MS1谱图中提取所有检测到肽段的前体同位素色谱图, 以及在 Skyline 中可视化并检查相应的结果。 (19 页)未修订版
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