以 Navarro, Nature Biotech 2016 基准论文为依据，使用为指示说明而创建的三物种混合数据集，获得从 Q Exactive 或 TripleTOF 仪器中采集的数据独立采集 (DIA) 数据的实际操作处理经验。对 DIA 使用“导入肽段搜索”向导以根据 DDA 数据构建谱图库，期间对保留时间校准进行自动 iRT 校准，并对肽段峰值检测采用 mProphet 学习模型。采用“保留时间”、“峰面积”、“质量精度”和 CV 等丰富的 Skyline 摘要图评估数据质量。最后进行群组比较，并对通过数据获取每个物种预期比率的效果进行评估。（31 页）

	Thermo Q Exactive	SCIEX TripleTOF