MS1 全扫描筛选

2021-10-20

动手创建 Skyline 文档,使用数据依赖采集 (DDA) 实验中的 MS1 扫描数据来测量肽段表达的定量差异。在本教程中,您将学习从探索性实验数据集中构建图谱库,为 MS1 过滤配置 Skyline 文档,导入质谱仪原始数据文件,以从 MS1 扫描中提取母离子色谱图,然后根据 MS/MS 图谱肽段鉴定信息挑选合适的色谱峰,以及利用 Skyline 进一步处理得到的定量数据。如果您对探索性实验无标记定量分析感兴趣,本教程将帮助您认识一种新的研究工具。(41 页)

[下载]

* - 1.2 版本中开始引入,然后针对 1.4 版本进行了更新,针对 2.5 版本进行了修订,继而又针对 20.1 版本进行了更新,继而又针对 21.1 版本进行了更新。

另外, 关于Skyline无标记定量的算法和工作流程,更多内容参考我们发表在Molecular Cellular Proteomics 上的文章(请引用该文章):
Platform independent and label-free quantitation of proteomic data using MS1 extracted ion chromatograms in skyline. Application to protein acetylation and phosphorylation
[摘要]