针对靶向蛋白质组学实验亲自动手创建 Skyline 文档。在此指南中, 您将学会从 pepXML 和 mzXML 文档以及 FASTA 格式的背景蛋白质组文件中创建 MS/MS 谱图库。您将把这些信息与在 GPM 数据库网站 (Gobal Proteome Machine) 上的某个公共 MS/MS 谱图库相结合，按照指引创建全新的 Skyline 文档，对一些特定的酵母蛋白质、肽段和子离子进行靶向分析。根据此 Skyline 文档，您将导出一个离子对列表，以供直接在 AB 4000 Q Trap 型质谱仪上进行检测分析。（25 页）。

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* - Skyline 0.6 版本中开始引入, 继而分别对 1.4、2.5、3.7、20.1 版本进行了更新。

2015 年 2 月 10 日，Skyline 团队举办了第 4 场网络研讨会：Skyline 靶向方法设计，这是该基础课题的又一重要资源。

[网络研讨会]